Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp17leQ7M764 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp17leQ7M764 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms