Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmeff1Q6PFE7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Tmeff1Q6PFE7 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Tmeff1Q6PFE7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Tmeff1Q6PFE7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Tmeff1Q6PFE7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmeff1Q6PFE7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms