Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zbtb39Q6PDK0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb39Q6PDK0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms