Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Thsd7bQ6P4U0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Thsd7bQ6P4U0 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thsd7bQ6P4U0 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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