Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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NipblQ6KCD5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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NipblQ6KCD5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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NipblQ6KCD5 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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NipblQ6KCD5 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
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NipblQ6KCD5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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NipblQ6KCD5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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