Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CltbQ6IRU5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms