Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Arhgap20Q6IFT4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Arhgap20Q6IFT4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Arhgap20Q6IFT4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Arhgap20Q6IFT4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Arhgap20Q6IFT4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Arhgap20Q6IFT4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Arhgap20Q6IFT4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arhgap20Q6IFT4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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