Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nop58Q6DFW4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms