Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms