Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms