Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pkp4Q68FH0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms