Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms