Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Zfp248Q640N4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Zfp248Q640N4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Zfp248Q640N4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Zfp248Q640N4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Zfp248Q640N4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Zfp248Q640N4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Zfp248Q640N4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Zfp248Q640N4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Zfp248Q640N4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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