Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms