Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms