Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrhQ62361 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrhQ62361 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrhQ62361 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrhQ62361 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrhQ62361 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrhQ62361 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms