Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sycp1Q62209 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sycp1Q62209 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sycp1Q62209 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sycp1Q62209 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sycp1Q62209 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms