Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms