Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms