Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms