Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2bQ61313 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2bQ61313 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2bQ61313 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2bQ61313 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2bQ61313 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2bQ61313 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2bQ61313 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2bQ61313 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2bQ61313 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2bQ61313 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2bQ61313 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2bQ61313 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2bQ61313 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2bQ61313 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2bQ61313 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms