Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nell2Q61220 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nell2Q61220 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nell2Q61220 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nell2Q61220 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nell2Q61220 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nell2Q61220 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nell2Q61220 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nell2Q61220 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nell2Q61220 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nell2Q61220 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nell2Q61220 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nell2Q61220 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nell2Q61220 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nell2Q61220 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Nell2Q61220 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Nell2Q61220 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms