Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Usf1Q61069 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Usf1Q61069 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Usf1Q61069 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Usf1Q61069 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Usf1Q61069 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Usf1Q61069 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Usf1Q61069 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Usf1Q61069 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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