Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms