Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rbbp7Q60973 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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