Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms