Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf123Q5XPI3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms