Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms