Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacs2Q3V3Q7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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