Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ulk4Q3V129 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms