Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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