Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Znf48Q3US17 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Znf48Q3US17 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Znf48Q3US17 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Znf48Q3US17 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Znf48Q3US17 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Znf48Q3US17 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Znf48Q3US17 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Znf48Q3US17 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Znf48Q3US17 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Znf48Q3US17 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Znf48Q3US17 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Znf48Q3US17 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Znf48Q3US17 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Znf48Q3US17 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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