Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gtpbp6Q3U6U5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45625-201ENSMUST00000209412 650 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gtpbp6Q3U6U5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gtpbp6Q3U6U5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gtpbp6Q3U6U5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms