Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Q3U6N9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Q3U6N9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
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Q3U6N9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Q3U6N9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Q3U6N9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Q3U6N9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Q3U6N9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Q3U6N9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Q3U6N9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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