Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms