Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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