Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnpla6Q3TRM4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms