Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ccbe1Q3MI99 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccbe1Q3MI99 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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