Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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ptchd1Q14B62 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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ptchd1Q14B62 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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ptchd1Q14B62 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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ptchd1Q14B62 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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