Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms