Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tigd2Q0VBL1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms