Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms