Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
MitfQ08874 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MitfQ08874 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms