Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms