Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms