Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Cntn3Q07409 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cntn3Q07409 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cntn3Q07409 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cntn3Q07409 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cntn3Q07409 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Cntn3Q07409 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cntn3Q07409 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cntn3Q07409 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Cntn3Q07409 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Cntn3Q07409 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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