Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cab39Q06138 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms