Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs3Q05895 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms