Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Krtap22-2-201ENSMUST00000178913 380 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms