Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Nf1Q04690 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Nf1Q04690 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Nf1Q04690 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Nf1Q04690 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Nf1Q04690 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Nf1Q04690 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Nf1Q04690 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Nf1Q04690 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Nf1Q04690 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Nf1Q04690 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Nf1Q04690 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Nf1Q04690 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Nf1Q04690 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Nf1Q04690 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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